Lögregla segir að einn maður hafi verið handtekinn en að fleiri sé leitað.
Skotárásin átti sér stað í Paulus-hverfinu og segja þýskir fjölmiðlar að maður í herklæðum hafi hafi skothríð nálægt kebabveitingastað.
Þá hafa borist fréttir að handsprengju hafi verið kastað í átt að bænahúsi gyðinga á svæðinu, en fyrstu fréttir hermdu að árásin hafi átt sér stað nærri bænahúsinu þó að það hafi ekki fengist staðfest.
Íbúar í bænum Landsberg, norðaustur af Halle, hafa verið hvattir til að halda sig innandyra.
Um 240 þúsund manns búa í Halle, sem stendur við bakka árinnar Saale.
Fréttin hefur verið uppfærð.